DIA 蛋白质组分析技术

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所属分类:蛋白质组学

DIA 蛋白质组分析技术

数据非依赖型采集模式(Data-Independent Acquisition, DIA)逐渐崭露头角。相较于 DDA 数据采集模式在一级质谱中每个时间窗口采集较高的有限肽段离子(通常是 TOP20)进入二级质谱进行碎裂分析。DIA 将质谱整个全扫描范围分为若干个窗口,高速、循环地对每个窗口中的所有离子进行选择、碎裂及检测,从而无遗漏、无差异地获得样本中所有离子的全部碎片信息。

研究流程

DIA 蛋白质组分析技术

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分析结果

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PCA

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差异蛋白韦恩图

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蛋白网络互作图

案例分析

利用 DIA 技术,研究补体系统与精神异常的关系

Complement pathway changes at age 12 are associated with psychotic experiences at age 18 in a longitudinal population-based study: evidence for a role of stress

期刊:Molecular Psychiatry    
影响因子:11.973
发表时间:2019年    
发表单位:爱尔兰皇家外科学院

研究背景

补体级联是免疫系统的重要组成。越来越多的证据表明,补体系统异常与精神疾病有密切关系。

研究目的

为了进一步证明两者之间的关系,研究者对来自于 UK avon longitudinal study of parents and children (ALSPAC) 队列中的血液样本,进行了 DIA 蛋白质组检测,重点关注其中 29 个补体级联相关蛋白的表达水平。

研究结果

6 个蛋白的表达水平与精神异常相关。利用大鼠慢性应激模型,该研究结果进一步表明:慢性应激可能引起补体通路异常,与精神异常有显著相关性。

DIA 蛋白质组分析技术

图 1 差异蛋白丰度图

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图 2 通路相关的差异蛋白

参考文献

Föcking, Melanie, Sabherwal S , Cates H M , et al. Complement pathway changes at age 12 are associated with psychotic experiences at age 18 in a longitudinal population-based study: evidence for a role of stress[J]. Molecular Psychiatry, 2019

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