非标记定量蛋白质组学

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所属分类:蛋白质组学

非标记定量蛋白质组学

Label-free 蛋白质组分析技术

Label-free,即非标记定量技术,是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,它克服了传统的同位素标记的缺点,即过高的样品浓度 , 并且前处理少,更多保留样本最原始信息;对于低丰度多肽的覆盖程度更高;不受标记试剂盒限制,可进行大批量的样本检测。

研究流程

非标记定量蛋白质组学

样本要求

非标记定量蛋白质组学

分析结果

非标记定量蛋白质组学

案例分析

肌萎缩侧索硬化症脑脊液巨噬细胞生物标志物

Cerebrospinal fluid macrophage biomarkers in amyotrophic lateral sclerosis

期刊:Annals of Neurology    
影响因子:9.037
发表时间:2018年    
发表单位:英国牛津大学临床神经科学系

研究背景

神经退行性疾病肌萎缩侧索硬化症 (ALS) 是一种涉及多种分子途径的异质性临床综合征。

研究方法

我们使用高通量蛋白质组学方法来识别单个脑脊液样本,发现几丁质酶 CHIT1、CHI3L1 和 CHI3L2 水平与 ALS患者疾病程度相关。

研究结果

3 种巨噬细胞来源的几丁质酶在 ALS 中含量增加:几丁糖苷酶 (CHIT1)、几丁质酶 -3 样蛋白 1(CHI3L1) 和几丁质酶 -3 样蛋白 2(CHI3L2)。

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图 1 差异蛋白含量及 ROC 曲线

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图 2 差异蛋白与疾病进展的相关性分析

结论

CHI3L1 升高是 ALS 和 PLS 的共同特征,而 CHIT1 和 CHI3L2 水平不同。几丁质酶水平与疾病进展率相关 CHIT1、CHI3L1 和 CHI3L2 水平与磷酸化神经丝重链相关。在低初始水平的人群中,CHI3L1 水平随时间增加,但 CHIT1或 CHI3L2 水平不随时间增加。CHIT1 值高与生存期缩短相关。

参考文献

Thompson A G ,Gray E ,Marie-Laëtitia Thézénas, et al. Cerebrospinal fluid macrophage biomarkers in amyotrophic lateral sclerosis[J]. Annals of Neurology, 2018, 83(2)

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