Molecular Cell文章:Arraystar LncRNA芯片应用于肝癌研究

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      第二军医大学孙树汉教授课题组长期致力于肝癌的研究。其课题组使用Arraystar LncRNA芯片研究肝癌,连续发表了6篇SCI文章,其中4篇发表在Hepatology;近期,其课题组的研究成员发现了能抑制肝癌转移的新分子:lncRNA-LET,该研究成果刊登在Molecular Cell上。( LncRNA芯片实验均由康成提供技术服务)

研究背景

    缺氧环境对肝癌,结肠癌,肺鳞癌的转移发挥关键作用。近来的研究发现lncRNA在多种肿瘤中异常表达并调控肿瘤的转移,但是,对于肿瘤中lncRNA表达调控的分子机制仍不清楚。孙树汉教授课题组本次研究目的在于揭示缺氧,lncRNA表达,肿瘤转移之间的关联。

研究思路

    研究者应用美国Arraystar公司的Human lncRNA芯片对5例肝癌组织和5例癌旁组织的lncRNA表达谱进行了比较,其中lncRNA-LET在肝癌组织中特异性低表达。并且验证发现lncRNA-LET在肝癌,结肠癌和肺鳞癌组织中的表达均显著下调,因此选择此lncRNA作为研究对象。

    对lncRNA-LET的功能研究发现,在缺氧条件下,lncRNA-LET能够抑制肝癌细胞的转移;进一步的机制研究表明在肝癌细胞中,缺氧条件促进组蛋白脱乙酰酶3 (HADC3)表达上调,引起结合在lncRNA-LET启动子区的组蛋白乙酰化减少,从而抑制lncRNA-LET的表达,lncRNA-LET的低表达导致HIF-1a表达增多,最终促进肝癌细胞转移。

    为了在临床验证lncRNA-LET的表达与乙酰化的关系,研究者对12例肝癌组织和对应癌旁组织检测发现,在肝癌组织中lncRNA-LET启动子区组蛋白乙酰化水平明显减少;并且相对于非转移性肝癌组织,lncRNA-LET在转移性肝癌组织样本中表达水平显著下调。

研究意义

该研究将缺氧,lncRNA低表达,肝癌细胞转移关联在一起,系统阐述了在缺氧条件下lncRNA的表达调控机制和lncRNA对肿瘤细胞转移的调控机制,这为肿瘤治疗提供了新的方向和靶点。

原文出处

Repression of the Long Noncoding RNA-LET by Histone Deacetylase 3 Contributes to Hypoxia-Mediated Metastasis. Molecular Cell. 2013.

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