GATK使用 基因组学

GATK使用

首先说说GATK可以做什么。它主要用于从sequencing 数据中进行variant calling,包括SNP、INDEL。比如现在风行的exome sequencing找variant,一般通过...
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测序量估计 基因组学

测序量估计

考虑这样一个问题,“如果要保证基因组上95%的区域其覆盖深度在30x以上的话,那么最低的平均测序深度应该是多少?”。关于测序量的估计,对于做生物信息的人来讲应算是家常便饭了,多数时候我们都能直接根据以...
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