DNA motif 搜索算法总结 基因组学

DNA motif 搜索算法总结

DNA功能域(motif)简单地讲就是一段特定模式的DNA序列,它之所以可以具有生物学功能是因为它的特殊序列可以和调控蛋白结合,比如转录因子,从而可以在短暂时间内锚定功能蛋白。通常,DNA功能域的长度...
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一文学会WGCNA分析 基因组学

一文学会WGCNA分析

基本概念WGCNA其译为加权基因共表达网络分析。该分析方法旨在寻找协同表达的基因模块(module),并探索基因网络与关注的表型之间的关联关系,以及网络中的核心基因。适用于复杂的数据模式,推荐5组(或...
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VCF格式 基因组学

VCF格式

CHROM 染色体编号POS 位置ID 基因IDREF 参考基因组碱基ALT 样本碱基QUAL 变异可信度,越高越好QUAL:Phred格式(Phred_scaled)的质量值,表 示在该位点存在va...
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基因组数据库-一个物种的官网 基因组学

基因组数据库-一个物种的官网

基因组数据库相当于一个物种的官网,关心该物种的科学家可以通过访问网站了解物种信息、科研进展、做blast等简单分析、下载基因组数据,基因组数据库最核心的模块是基因组浏览器,可以可视化查看基因结构、变异...
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