Gbrowse SNV突变频率图绘制 基因组学

Gbrowse SNV突变频率图绘制

基因组的某位置,会发生突变,或者说对于多个物种的个体进行测序的话,会发现许多位置不是稳定的只是某个碱基,而应该用频率表示,ACTG出现的频率,如果某个位置有出现两个以上碱基的可能性,我们就将这个位置称...
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hmmer的安装与使用 基因组学

hmmer的安装与使用

从功能基因研究的角度来讲,相关的搜索,比如从序列数据库中,找同源的序列,或者对一个对一个新的基因功能进行鉴定,使用hmmer比使用blast有着更高的灵敏度已经更高的搜索速度,但其应用还远没有blas...
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CAP3的使用方法 基因组学

CAP3的使用方法

 Cap3简介Huang, X. 和 Madan, A 开发的一套用于序列拼接的软件,此软件适用于小的数据集或 EST 拼接,它有如下特征:利用正反向进行拼接,更正拼接错误、连接 contigs。应用...
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