GSEA结果解读 生物信息学

GSEA结果解读

1 Enrichment score(ES)ES是GSEA最初的结果,反应全部杂交data排序后,在此序列top或bottom富集的程度。 ES原理:扫描排序序列,当出现一个功能集中的gene时,增加...
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GSEA分析结果详细解读 生物信息学

GSEA分析结果详细解读

在解读传统的富集分析结果时,经常会有这样的疑问,一个富集到的通路下,既有上调差异基因,也有下调差异基因,那么这条通路总体的表现形式究竟是怎样呢,是被抑制还是激活?或者更直观点说,这条通路下的基因表达水...
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GEO数据库简介 生物信息学

GEO数据库简介

为了支持公共使用和散布基因表达数据,NCBI开始了基因表达汇编(GEO)计划。GEO是努力建立一个基因表达数据仓库和在线资源,用于从任何物种或人造的来源检索基因表达数据。来自microarray,高密...
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