上传测序数据到GEO 生物信息学

上传测序数据到GEO

首先向大家简单介绍下GEO数据库,它是为了共享基因表达数据而建立的一个在线数据库。很多文章发表都需要上传到GEO数据库,还不赶紧学习下,(*^__^*)。如果要上传GEO数据库,首先要建立一个NCBI...
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蛋白亲疏水性分析工具 生物信息学

蛋白亲疏水性分析工具

氨基酸的疏水性(Hydrophobicity)反映蛋白质的折叠情况,在潜在的跨膜区域会出现疏水区,并且在保持蛋白质的三级结构上(比如维持生物膜的结构)起重要作用。蛋白的亲疏水性(Hydropathic...
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用ImageJ对条带进行定量分析 生物信息学

用ImageJ对条带进行定量分析

ImgaeJ是一款比较常用的科研图片分析软件,在之前已介绍过用它来进行细胞计数、不同颜色通道的荧光照片的融合和不规则区域面积的测定等(参见 拓展阅读部分)。其实,它被广泛用于胶图条带的定量分析,如下图...
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R语言实现决策曲线分析 生物信息学

R语言实现决策曲线分析

大家对ROC曲线都很熟悉,从方法的特异性和灵敏度出发反应一个方法的准确度。但是,在临床的应用中,往往仅通过以上标准得到的准确度是不可靠的。故早在2006年纪念斯隆-凯特琳癌症中心AndrewVicke...
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