二代测序的Barcode选择 生物信息学

二代测序的Barcode选择

1 混合样本测序现代测序仪的生产能力正在经历突飞猛进的提高,数据量远远大于单个样本测序所需,因此在很多情况下,需要把多个样本混合在一起测序,以充分发挥仪器的能力,节约测序成本。像外显子组测序、转录组测...
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GSEA使用事项小结 生物信息学

GSEA使用事项小结

最近为了了解下GSEA的算法的整体思路以及软件一些主要参数的具体含义,从头看了下其R代码,由于其R代码是作者在软件早期写的,其功能并不是很完善,但是其核心的思路还是在代码中体现出来了(其实主要还是GS...
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下载所有的酶的信息 生物信息学

下载所有的酶的信息

之前我提到过kegg数据库里面的有些pathway下面没有对应任何基因,当时我还在奇怪,怎么会有这样的通路呢?然后,我随机挑选了其中一条通路(hsa01000),进行查看,发现正好是所有的酶的信息。好...
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NCBI SRA数据库使用详解 生物信息学

NCBI SRA数据库使用详解

做为一个合格的生物信息菜鸟,没钱测序咋整,免不了到处求数据呀找数据.....练好基本功必须先从找数据开始!今天小编就来介绍一下一个存储大量高通量数据的的数据库-SRA。1、简介SRA(Sequence...
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