预后研究与预测模型 生物信息学

预后研究与预测模型

临床研究中,对于疾病的预后研究的应用非常普遍,最负盛名如Framingham研究,开发了一系列的预测模型。本章我们就什么是医学预测模型、如何开发预测模型、如何做模型的验证,如何应用等问题做一些概要介绍...
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FASTQ格式解释和质量评估 生物信息学

FASTQ格式解释和质量评估

FASTQ文件格式和命名高通量测序之后用于下游分析的数据一般存储在FASTQ文件中。为了节省空间,又不影响下游使用,也一般用gzip压缩的格式。单端测序每个文库只返回一个FASTQ文件,双端测序两个F...
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如何批量下载指定的序列? 生物信息学

如何批量下载指定的序列?

【絮语】下载序列简单不过,无非就是联网NCBI主页,选择数据库后输入AC号或GI号后直接下载。但是如何大批量下载,而且下载的序列是指定的AC或GI的呢?实现这一目的通常办法是借助一些生物软件的检索功能...
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多重序列比对的着色美化 生物信息学

多重序列比对的着色美化

【絮语】多重比对是核苷酸和氨基酸序列分析的重要内容之一,通过多重比对,可以找出序列的保守区域,可以为分子进化分析提供依据。但由于软件的功能限制,一些比对软件生成的比对文件,如Clustalx的*.al...
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