【宏蛋白质组】搜库工具简介与评估

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所属分类:生物信息学

宏蛋白质组数据分析相对较难,不同于常规蛋白质组分析,因为数据库太大,无法直接进行搜库匹配,需要对数据库进行优化。整理了几个发表的宏蛋白搜库分析工具。具体效果如何,还需要测试。
1.ProteoStorm
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2. MetaPro-IQ
主要针对肠道样本搜库的分析策略,采用3步迭代法。没有打包成工具。
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3.diatools
针对DIA肠道菌群数据。
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4. Unipept
主要针对下游分析,如物种注释和功能分析。特点,直接从肽段水平去做物种和功能注释。
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5.MetaProteomeAnalyzer
采用的是两步搜库法。
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