21款生物信息在线分析工具汇编

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所属分类:生物信息学

  1,promoter scan

  功能:启动子预测

  网址:https://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/proscan/

  2,ORF finder

  功能:ORF预测

  网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/

  3,NCBI-BLAST

  功能:序列比对

  网址:https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

  4,MUSCLE

  功能:运行速度比较快的多序列比对

  网址:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/muscle/#

  5,CLUSTAL OMEGA

  功能:DNA、RNA、蛋白的多序列比对

  网址:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/

  6,CLUSTALW2

  功能:应用较广泛的多序列比对

  网址:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/

  7,T-COFFEE

  功能:准确度高,速度慢的多序列比对

  网址:http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/tcoffee/

  8,SimiTriX-SimiTetra

  功能:多序列比对相似性展示

  网址:http://cotton.hzau.edu.cn/EN/tools/BioERCP/simitrix.php

  9, Venn图

  功能:绘制Venn图

  网址:http://www.biovenn.nl/index.php

  10. Venn图

  功能:绘制Venn图

  网址:http://bioinformatics.psb.ugent.be/cgi-bin/liste/Venn/calculate_venn.htpl

  11,Venn图

  功能:绘制Venn图

  网址:http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

  12,WEGO

  功能:绘制GO注释结果图

  网址:http://wego.genomics.org.cn/cgi-bin/wego/index.pl

  13. CIRCOS

  功能:绘制圈图

  网址:http://mkweb.bcgsc.ca/tableviewer/visualize/

  14.CIRCexplorer

  功能:进行circRNA分析

  网址:http://circexplorer2.readthedocs.io/en/latest/

  15.iPath

  功能:进行可视化通路图在线分析

  网址:http://pathways.embl.de/

  16.KEGG

  功能:进行基因的代谢通路注释

  网址:http://www.kegg.jp/blastkoala/

  17.UCSC

  功能:进行基因组可视化

  网址:http://genome.ucsc.edu/index.html

  18.IBS

  功能:进行序列结构示意图绘制

  网址:http://ibs.biocuckoo.org/online.php

  19.RAP

  功能:在线分析RNA-seq

  网址:https://bioinformatics.cineca.it/rap/

  20.AUGUSTUS

  功能:基因外显子内含子,UTR,注释

  网址:http://bioinf.uni-greifswald.de/webaugustus/prediction/create

  21.GSDS

  功能:基因外显子内含子,UTR,domain等区域特征展示

  网址:http://gsds.cbi.pku.edu.cn/

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