利用BankIt向NCBI提交序列方法

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所属分类:生物信息学

向NCBI提交序列常用的程序有两个,一个是在线提交的BankIt,一个是用软件Sequin。用哪种办法,根据不同的需要。

BankIt:(在线提交页面:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BankIt/index.html)

适合单个或少量几个的提交喜欢用在线的方式提交,无需下载个软件你的序列的注释不复杂提交你的序列时不需要用到序列的分析

Sequin(下载页面:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Sequin/index.html)

提交的是批量而且比较复杂的序列you are submitting mutation, phylogenetic, population, environmental, or segmented sets喜欢图形的界面,有更的选项和功能,可以批量修改获得相关的分析工具

这里简单介绍一下在线提交序列程序BankIt,Sequin也是大同小异的。

1,打开GenBank

利用BankIt向NCBI提交序列方法

2,进入Submit to GenBank

利用BankIt向NCBI提交序列方法

3,左边出现几个工具的选择,点击BankIt。在BankIt提交页面的最下面,填上你要提交的序列的长度,点New

利用BankIt向NCBI提交序列方法

4,点New后,会生成一个bankit号,记住这个号。下面根据需要填写一些必需的内容。名字和序列

利用BankIt向NCBI提交序列方法

5,填好资料后,可以在本地保留一份备份。如果确认无误,再提交数据(Validate and continue)

利用BankIt向NCBI提交序列方法

6,万一填的资料有误或者漏填。其中有一个error提醒。其中姓名,电话,Email,序列等都是必须的。

利用BankIt向NCBI提交序列方法

最后NCBI会给您发个邮件,一般在1到2周会有NCBI会处理数据,有问题会继续给你发邮件通知。如果没问题,一般一个月内就会得到Accession Number。如果是用Sequin,填好资料过程中可以随时保存,最后你只需把最后确认的文件向NCBI发封邮件就可以了。

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