DNAstar软件的使用(四)Seqman 去除载体

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所属分类:生物信息学

插入到载体上的片段在分析前需要先去除载体序列,而Seqman 提供了自动去除载体的功能,你只需选择你的载体类型即可,点击图中的下拉框即可看到软件自带的载体文件

DNAstar软件的使用(四)Seqman 去除载体

选择好前后载体后,导入文件的Vector一栏会有显示,注意两栏都要选上

DNAstar软件的使用(四)Seqman 去除载体

选好之后点击Options会弹出一个对话框,点击Scan All即可

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扫描完成后,如果导入序列与目标载体类型匹配载体明称之前会显示√,表两者相匹配。

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双击文件名会弹出峰形图并显示载体序列的位置,插入片段开始与结束的位置也一目了然。

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如在下拉框中找不到你的载体,点击菜单栏的Project---Vector catalog

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接着弹出载体编辑工具,在这里可以新建或编辑一个载体文件,新建载体文件需要先把载体的序列文件(.Seq格式)放入到安装目录的VectorData文件夹下,在这个文件夹也可以找到已有的载体序列

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然后点击New,导入载体的序列文件,设置好克隆位点在载体上的位置,以及需要将载体序列与测序结果比对的区间即可

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