批量提取fasta记录的小应用(界面版)

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所属分类:生物信息学

“就提取几个序列,不需要命令行”

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刚接触生物信息学的同学,或者(和我一样)只是使用生物信息相关知识来服务伟大种树事业的同学,

有时候需要“根据一个基因id列表,批量提取fasta记录

这里提供一个jar包,

下载链接(360网盘):

http://yunpan.cn/csbp7j7fmhkAZ  访问密码 6b43

 

使用说明:

1.点击A Fasta files ,选择待提取的fasta文件2.点击An ID List,选择id 列表文件,(每行1个id)3.点击Set Output Directory,设定输出文件目录4.点击Get Result !5.根据弹窗信息,在第3.步中设定的输出文件目录下可以找到结果文件

 

 FAQ:

-1. 请先安装java….jvm…一般都是已安装的

0. 关于非命令行版,也写了,只是不如直接用perl命令行,见《生物信息初学者常用perl-oneliner》

1. Must 设定输出文件目录…java基础还有限,等书到了,学习完了再优化

2. 任何其他问题,请留言

原文地址:一个生物信息初学者的blog http://www.pineapplechina.com/?p=142

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