信息生物学

  • A+
所属分类:生物信息学
后基因组研究如基因组序列或功能分析以及基因交互识别等如果没有大量数据处理技术是无法进展的. 因此, 一个名为信息生物学(Bioinformatics), 藉由联合高性能计算机和高效数据处理运算法则的新研究领域出现了.

首先它被用于计算人类基因组计划得出的遗传碱基序列, 从而得出蛋白质功能. 虽然已发现了大多数基因的碱基序列和氨基酸序列一级结构, 仅少量蛋白质的功能是已知的. 因此, 信息生物学通过使用基因碱基序列数据和比较已知及未知功能的基因, 从而类推未知的基因功能. 他们不仅简单比较序列, 而且试图根据蛋白质碎片结构模块化的事实通过重组每个模块来推断功能. 虽然只是一个模拟步骤, 但有传言说他们已经达到推断80~90%基因功能的水平.

另一方面, DNA芯片关于全基因组研究的实验数据, 也需要数据处理技术来解释众多基因表达的生理意义. 基因表达模式研究将会成为新治疗和诊断的基础知识, 而且它将会提供基因互相影响的信息. 目前, 他们根据基因的表达速率或形式来建立群, 而且设想比较靠近的群中的基因物理上或生理上是相近的. 市面上已有几个专业的软件用来处理这些DNA芯片的实验数据.

信息生物学也被用于解释蛋白质交互作用的网络. 最终, 可以通过输入从信息生物学得出的蛋白质功能和表达数据来建立一个虚拟细胞, 完美地模拟细胞功能. 如果虚拟细胞的研究进一步扩展, 可以创造虚拟的动物或病人, 这样新药物的研究就可以只需通过计算机(虚拟系统)而无须任何现实的或者活体的实验. 尽管现在数据不足不能完成所描绘的蓝图, 已经可以建立一些有趣的模型.

Bioinformatics
Celera has also built one of the most powerful non-government supercomputing facilities in the world, featuring 800 interconnected Compaq Alpha-based, true 64-bit computer systems, each of which is capable of performing more than 250 billion sequence comparisons per hour. This facility is being used to assemble DNA fragments into complete genomes, and will be used for comparative analysis. It also provides linkages to customer computers on site, and will act as an electronic delivery system for use over the Internet. The company also has an alliance with Oracle for complete database development and infrastructure for all planned Celera Genomics Databases, including Drosophila (fruit fly), human, mouse, and others.  (责任大汉昆仑王)

  • 蛋白质组学业务咨询
  • 扫码咨询相关问题
  • weinxin
  • 代谢组学业务咨询
  • 扫码咨询相关问题
  • weinxin

发表评论

:?: :razz: :sad: :evil: :!: :smile: :oops: :grin: :eek: :shock: :???: :cool: :lol: :mad: :twisted: :roll: :wink: :idea: :arrow: :neutral: :cry: :mrgreen: